В период с 16 по 18 сентября 2009 года был проведен внешний аудит на соответствие системы менеджмента качества ЗАО «ЭКОС-1» требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2008 (ИСО 9001:2008). В ходе аудита было сделано несколько незначительных замечаний.

Комиссия органа по сертификации систем качества рекомендовала ОАО «ВНИИС», после одобрения выполненных компанией корректирующих действий, выдать ЗАО «ЭКОС-1» сертификат соответствия системы менеджмента качества требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2008 (ИСО 9001:2008) сроком на три года.